MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-3

Total Repeats: 970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011416	AC	3	6	53	58	50 %	0 %	0 %	50 %	209921876
2	NC_011416	CGG	2	6	93	98	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921876
3	NC_011416	ACA	2	6	116	121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921876
4	NC_011416	GGGAT	2	10	141	150	20 %	20 %	60 %	0 %	209921876
5	NC_011416	CT	3	6	215	220	0 %	50 %	0 %	50 %	209921876
6	NC_011416	TAA	2	6	228	233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921876
7	NC_011416	AAT	2	6	343	348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921876
8	NC_011416	TGA	2	6	486	491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921876
9	NC_011416	T	7	7	519	525	0 %	100 %	0 %	0 %	209921876
10	NC_011416	GAA	2	6	526	531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921876
11	NC_011416	A	6	6	611	616	100 %	0 %	0 %	0 %	209921876
12	NC_011416	C	6	6	626	631	0 %	0 %	0 %	100 %	209921876
13	NC_011416	ATT	2	6	646	651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921876
14	NC_011416	ACA	2	6	677	682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921876
15	NC_011416	ATG	2	6	758	763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921876
16	NC_011416	ACG	2	6	783	788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921876
17	NC_011416	CGG	2	6	834	839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921876
18	NC_011416	TAT	2	6	990	995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921876
19	NC_011416	GGCA	2	8	1019	1026	25 %	0 %	50 %	25 %	209921876
20	NC_011416	CTG	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921877
21	NC_011416	ATT	2	6	1108	1113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921877
22	NC_011416	TTTCTG	2	12	1226	1237	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	209921877
23	NC_011416	GC	3	6	1292	1297	0 %	0 %	50 %	50 %	209921877
24	NC_011416	GCT	2	6	1337	1342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921877
25	NC_011416	TGG	2	6	1385	1390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209921877
26	NC_011416	CGG	2	6	1398	1403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921877
27	NC_011416	TCG	2	6	1442	1447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921877
28	NC_011416	TG	3	6	1504	1509	0 %	50 %	50 %	0 %	209921877
29	NC_011416	AGGCG	2	10	1572	1581	20 %	0 %	60 %	20 %	209921877
30	NC_011416	TACCG	2	10	1591	1600	20 %	20 %	20 %	40 %	209921877
31	NC_011416	GCA	2	6	1621	1626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921877
32	NC_011416	TTG	3	9	1661	1669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921877
33	NC_011416	TCC	2	6	1671	1676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209921877
34	NC_011416	TGA	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921877
35	NC_011416	GTT	2	6	1701	1706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921877
36	NC_011416	A	6	6	1711	1716	100 %	0 %	0 %	0 %	209921877
37	NC_011416	TGA	2	6	1875	1880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921878
38	NC_011416	GGC	2	6	1973	1978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921878
39	NC_011416	CTG	2	6	1994	1999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921878
40	NC_011416	ACC	2	6	2051	2056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921878
41	NC_011416	TG	3	6	2151	2156	0 %	50 %	50 %	0 %	209921878
42	NC_011416	TGA	2	6	2167	2172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921878
43	NC_011416	ATT	2	6	2375	2380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921878
44	NC_011416	TG	3	6	2432	2437	0 %	50 %	50 %	0 %	209921878
45	NC_011416	CAC	2	6	2450	2455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921878
46	NC_011416	AGG	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209921878
47	NC_011416	A	7	7	2609	2615	100 %	0 %	0 %	0 %	209921878
48	NC_011416	ATT	2	6	2632	2637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921878
49	NC_011416	TCA	2	6	2673	2678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921878
50	NC_011416	TGGA	2	8	2709	2716	25 %	25 %	50 %	0 %	209921878
51	NC_011416	CCG	2	6	2877	2882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921878
52	NC_011416	TTC	2	6	3704	3709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921879
53	NC_011416	AAATT	2	10	3783	3792	60 %	40 %	0 %	0 %	209921879
54	NC_011416	CCAG	2	8	3826	3833	25 %	0 %	25 %	50 %	209921879
55	NC_011416	TCA	2	6	3837	3842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921879
56	NC_011416	CAC	2	6	3877	3882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921879
57	NC_011416	GCA	2	6	3903	3908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921879
58	NC_011416	GAT	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921880
59	NC_011416	CA	3	6	4693	4698	50 %	0 %	0 %	50 %	209921880
60	NC_011416	CAG	2	6	4718	4723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921880
61	NC_011416	AGC	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921880
62	NC_011416	AGGA	2	8	4812	4819	50 %	0 %	50 %	0 %	209921880
63	NC_011416	CTG	2	6	4827	4832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921880
64	NC_011416	GCC	2	6	4835	4840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921880
65	NC_011416	GTT	2	6	4850	4855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921880
66	NC_011416	TGC	2	6	4870	4875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921880
67	NC_011416	CTC	2	6	4937	4942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209921880
68	NC_011416	AAG	2	6	4944	4949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921880
69	NC_011416	TGGA	2	8	5086	5093	25 %	25 %	50 %	0 %	209921881
70	NC_011416	GCC	2	6	5096	5101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921881
71	NC_011416	GTC	2	6	5105	5110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921881
72	NC_011416	TGA	2	6	5115	5120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921881
73	NC_011416	TCG	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921881
74	NC_011416	GCT	2	6	5193	5198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921881
75	NC_011416	GAAA	2	8	5340	5347	75 %	0 %	25 %	0 %	209921881
76	NC_011416	CTG	2	6	5427	5432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921881
77	NC_011416	GCACT	2	10	5443	5452	20 %	20 %	20 %	40 %	209921881
78	NC_011416	GGC	2	6	5467	5472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921881
79	NC_011416	CGC	2	6	5518	5523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921881
80	NC_011416	GAA	2	6	5631	5636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921881
81	NC_011416	CGG	2	6	5639	5644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209921881
82	NC_011416	AG	3	6	5673	5678	50 %	0 %	50 %	0 %	209921881
83	NC_011416	GCA	2	6	5729	5734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921881
84	NC_011416	TCGC	2	8	5797	5804	0 %	25 %	25 %	50 %	209921882
85	NC_011416	GCA	2	6	5821	5826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921882
86	NC_011416	T	7	7	6307	6313	0 %	100 %	0 %	0 %	209921883
87	NC_011416	TGC	2	6	6320	6325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921883
88	NC_011416	A	8	8	6331	6338	100 %	0 %	0 %	0 %	209921883
89	NC_011416	TAA	2	6	6362	6367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921883
90	NC_011416	TAA	2	6	6407	6412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921883
91	NC_011416	ATT	2	6	6457	6462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921883
92	NC_011416	AAT	2	6	6463	6468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921883
93	NC_011416	AATG	2	8	6487	6494	50 %	25 %	25 %	0 %	209921883
94	NC_011416	AGA	2	6	6562	6567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921883
95	NC_011416	AGAT	2	8	6709	6716	50 %	25 %	25 %	0 %	209921883
96	NC_011416	CCAG	2	8	6837	6844	25 %	0 %	25 %	50 %	209921883
97	NC_011416	ATCAAA	2	12	6864	6875	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	209921883
98	NC_011416	AT	3	6	6891	6896	50 %	50 %	0 %	0 %	209921883
99	NC_011416	CAT	2	6	6924	6929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921883
100	NC_011416	A	6	6	6937	6942	100 %	0 %	0 %	0 %	209921883
101	NC_011416	ATT	2	6	6972	6977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921883
102	NC_011416	A	7	7	7005	7011	100 %	0 %	0 %	0 %	209921883
103	NC_011416	A	6	6	7020	7025	100 %	0 %	0 %	0 %	209921883
104	NC_011416	ATAGT	2	10	7049	7058	40 %	40 %	20 %	0 %	209921883
105	NC_011416	CAA	2	6	7063	7068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921883
106	NC_011416	ATA	2	6	7171	7176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921883
107	NC_011416	TAA	2	6	7188	7193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921883
108	NC_011416	AAT	2	6	7197	7202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921883
109	NC_011416	GA	3	6	7867	7872	50 %	0 %	50 %	0 %	209921884
110	NC_011416	AGC	2	6	7928	7933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921884
111	NC_011416	ATA	2	6	8140	8145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921885
112	NC_011416	TTA	2	6	8239	8244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921885
113	NC_011416	GAA	2	6	8755	8760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921886
114	NC_011416	CTG	2	6	8793	8798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921886
115	NC_011416	AGTG	2	8	8807	8814	25 %	25 %	50 %	0 %	209921886
116	NC_011416	CTT	2	6	8817	8822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921886
117	NC_011416	TGT	2	6	8851	8856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921886
118	NC_011416	TGGA	2	8	8926	8933	25 %	25 %	50 %	0 %	209921886
119	NC_011416	GTGC	2	8	8967	8974	0 %	25 %	50 %	25 %	209921886
120	NC_011416	CGCC	2	8	8985	8992	0 %	0 %	25 %	75 %	209921886
121	NC_011416	GAT	2	6	9056	9061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921886
122	NC_011416	CAC	2	6	9062	9067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209921886
123	NC_011416	CGT	3	9	9075	9083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921886
124	NC_011416	CGA	2	6	9104	9109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921886
125	NC_011416	CGC	2	6	9184	9189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921886
126	NC_011416	CTGG	2	8	9258	9265	0 %	25 %	50 %	25 %	209921886
127	NC_011416	CGGG	2	8	9353	9360	0 %	0 %	75 %	25 %	209921886
128	NC_011416	TGC	2	6	9362	9367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921886
129	NC_011416	GACT	2	8	9769	9776	25 %	25 %	25 %	25 %	209921887
130	NC_011416	T	6	6	9776	9781	0 %	100 %	0 %	0 %	209921887
131	NC_011416	TCA	2	6	9816	9821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921887
132	NC_011416	AGA	2	6	9859	9864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921887
133	NC_011416	GCT	2	6	9919	9924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921887
134	NC_011416	CT	3	6	10029	10034	0 %	50 %	0 %	50 %	209921887
135	NC_011416	GTA	2	6	10178	10183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921887
136	NC_011416	CA	3	6	10327	10332	50 %	0 %	0 %	50 %	209921887
137	NC_011416	CAA	2	6	10345	10350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921887
138	NC_011416	GAAT	2	8	10395	10402	50 %	25 %	25 %	0 %	209921887
139	NC_011416	CCCA	2	8	10407	10414	25 %	0 %	0 %	75 %	209921887
140	NC_011416	TATCCA	2	12	10429	10440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921887
141	NC_011416	T	8	8	10536	10543	0 %	100 %	0 %	0 %	209921887
142	NC_011416	TTC	2	6	10548	10553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921887
143	NC_011416	GTT	2	6	10613	10618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921887
144	NC_011416	GTGTCA	2	12	10627	10638	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209921887
145	NC_011416	GAC	2	6	10650	10655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921887
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147	NC_011416	GGT	2	6	11471	11476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209921888
148	NC_011416	GCT	2	6	11483	11488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921888
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151	NC_011416	TTC	2	6	11562	11567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209921888
152	NC_011416	GCT	2	6	11627	11632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209921888
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157	NC_011416	CCG	2	6	11774	11779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209921888
158	NC_011416	ATTGA	2	10	11784	11793	40 %	40 %	20 %	0 %	209921888
159	NC_011416	GTA	2	6	12151	12156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209921889
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165	NC_011416	A	6	6	12479	12484	100 %	0 %	0 %	0 %	209921889
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169	NC_011416	GCCG	2	8	12605	12612	0 %	0 %	50 %	50 %	209921889
170	NC_011416	TTA	2	6	12648	12653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921889
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232	NC_011416	TAC	2	6	17903	17908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921896
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246	NC_011416	TA	3	6	19088	19093	50 %	50 %	0 %	0 %	209921898
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248	NC_011416	AAT	2	6	19270	19275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921898
249	NC_011416	AAT	2	6	19358	19363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921898
250	NC_011416	T	6	6	19461	19466	0 %	100 %	0 %	0 %	209921898
251	NC_011416	CAG	2	6	19571	19576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209921898
252	NC_011416	CAT	2	6	19592	19597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921898
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255	NC_011416	TAA	2	6	19808	19813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209921898
256	NC_011416	ATC	3	9	19907	19915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209921898
257	NC_011416	C	7	7	19966	19972	0 %	0 %	0 %	100 %	209921898
258	NC_011416	AAG	2	6	20006	20011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209921898
259	NC_011416	CGCCAG	2	12	20018	20029	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209921898
260	NC_011416	AAGC	2	8	20035	20042	50 %	0 %	25 %	25 %	209921898
261	NC_011416	CAGAG	2	10	20148	20157	40 %	0 %	40 %	20 %	209921898
262	NC_011416	TAT	2	6	20158	20163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209921898
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264	NC_011416	A	6	6	20355	20360	100 %	0 %	0 %	0 %	209921898
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269	NC_011416	T	6	6	20826	20831	0 %	100 %	0 %	0 %	209921899
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388	NC_011416	TGT	2	6	27296	27301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209921905
389	NC_011416	A	6	6	28246	28251	100 %	0 %	0 %	0 %	209921906
390	NC_011416	ACA	2	6	28258	28263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209921906
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392	NC_011416	G	9	9	28377	28385	0 %	0 %	100 %	0 %	209921906
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